Η λειτουργία του συστήματος CIP είναι να καθαρίζει αυτόματα όλες τις επιφάνειες που έρχονται σε επαφή με προϊόντα, συμπεριλαμβανομένου του εσωτερικού τοιχώματος της δεξαμενής, του εσωτερικού τοιχώματος του σωλήνα, του εσωτερικού τοιχώματος του κυλίνδρου υγρού και άλλων διόδων υγρού.
Το σύστημα CIP αποτελείται συνήθως από δεξαμενή αποθήκευσης υγρού καθαρισμού, συσκευή προσθήκης οξέος και αλκαλίου, θερμαντήρα, αντλία καθαρισμού και αντλία επιστροφής, καθώς και αγωγούς, ομάδα βαλβίδων ατμού και ούτω καθεξής.